1、花期温度调控在菜椒坐果后，要注意温度不能过低，这时棚室内的温度超过35度或32度以上两个小时，那么辣椒就会出现授粉或者授精不良的现象。秋季产生畸形果主要是因为高温造成的，在春季前后坐果后也会这种这种症状，往往果实像一个桃子一样，果实内部没有发育好的种子。所以要尽量避免大棚内气温或者地温过低，影响到菜椒正常坐果，在春季坐果前后，可以冲施复合肥和生物菌肥，能增加坐果率。

2、平衡施肥菜椒在缺乏硼钙等元素时就会选择畸形果现象，或者种子发育不完全，所以除了土壤施肥外，还需注意叶面喷肥，经常喷洒含有硼钙等元素的叶面肥，能有效的促进菜椒坐果。平衡施肥，尽量减少氮肥的施用量，增施钾肥，比如磷酸二氢钾、硫酸钾复合肥，有利于坐果。

3、调整长势菜椒植株的长势对坐果也会有一定有效，如植株营养生长过晚，造成植株徒长，菜椒果实出现畸形的概率就会加大，可以通过喷洒生长调节剂或者整枝打杈的方法调整长势，促进坐果。如果菜椒本身坐不住果，养分就会被植株吸收，从而造成植株旺长，这时可以喷施助壮素和矮壮素抑制植株长势。喷洒时要现在晴天傍晚喷，控制温度主要是前期控制夜温避免营养生长过晚，生殖生长不足而影响到坐果率。

4、喷洒萘乙酸还可以在菜椒花期喷洒萘乙酸，每隔7-10天喷洒一次，连续喷施4-5次，这样能明显的提高菜椒坐果率，促进果实生长，从而增加结果数和单果重。